Post-doc / Ingénieur de recherche en biominéralisation (F/H)

Contexte du projet

La Rochelle Université recrute un ou une post-doctorante pour participer au projet de recherche ANR OPTIMIC, un projet interdisciplinaire visant à développer des stratégies innovantes de précipitation carbonatée induite par les microorganismes (MICP), optimisées par l’utilisation de biopolymères pour des applications en milieux poreux hétérogènes.

La MICP est un processus biogéochimique par lequel des microorganismes métaboliquement actifs induisent la précipitation de minéraux carbonatés, principalement du carbonate de calcium (CaCO₃), dans leur environnement immédiat. Cette précipitation résulte de réactions métaboliques microbiennes telles que l’hydrolyse de l’urée, qui modifient localement le pH et la chimie du milieu, favorisant la cristallisation de carbonates. La formation de CaCO₃ peut entraîner la cimentation de grains, la réduction de la porosité et une augmentation des propriétés mécaniques des matériaux. Grâce à ces propriétés, la MICP constitue aujourd’hui une approche prometteuse, durable et peu intrusive pour des applications telles que la réhabilitation de puits anciens, la stabilisation des sols, la réduction de perméabilité ou encore la protection des ressources en eau souterraine. Toutefois, l’efficacité de la MICP reste fortement limitée par la difficulté à contrôler la distribution des bactéries et des réactifs dans des milieux poreux naturellement hétérogènes.

Le projet OPTIMIC vise à lever ce verrou scientifique en évaluant l’apport de biopolymères afin d’améliorer le transport des bactéries et des nutriments, de limiter les écoulements préférentiels et de mieux contrôler la localisation et la morphologie des précipités carbonatés. Le projet repose sur une approche intégrée combinant microbiologie, géosciences, chimie des matériaux et modélisation numérique, en collaboration avec des partenaires nationaux et internationaux (deux partenaires français, BRGM (Orléans) et BIAM (Université Aix-Marseille), et un partenaire allemand).

Environnement de travail

Le poste sera basé à La Rochelle Université, au sein du laboratoire LIENSs (équipe BCBS : https://lienss.univ-larochelle.fr/BCBS-Biotechnologies-and-Chemistry-applied-to-Bioresources-for-Health), en étroite collaboration avec le laboratoire LaSIE (équipe TDVM : https://lasie-prod.univ-larochelle.fr/equipes-recherche/transferts-degradation-et-valorisation-des-materiaux/). Ces deux unités sont reconnues pour leurs travaux sur la biocalcification microbienne, les environnements marins et côtiers et les matériaux granulaires. Le ou la candidate évoluera dans un environnement scientifique interdisciplinaire et collaboratif (collaboration entre les deux équipes depuis plus de 15 ans). Des déplacements ponctuels vers les laboratoires partenaires en France et à l’international sont à prévoir.

Description des missions scientifiques

Le ou la candidate contribuera à l’étude des mécanismes bactériens individuels impliqués dans la MICP et à la caractérisation des produits de biominéralisation.

Il/elle participera à la sélection, l’isolement et la caractérisation de souches bactériennes biocalcifiantes, issues de milieux naturels (sols, ciments, roches) et de collections existantes. Les capacités de croissance, de survie et de biominéralisation de ces microorganismes seront étudiées dans des conditions représentatives des milieux d’application, incluant des variations de pH, de viscosité, ainsi que des atmosphères modifiées.

Une attention particulière sera portée aux interactions entre bactéries et biopolymères, tant du point de vue de la compatibilité biologique que de leur impact sur la cinétique, la localisation et la morphologie de la précipitation carbonatée. Le/la post-doctorant·e étudiera également la capacité des systèmes MICP développés à consolider des substrats granulaires (sables et sols fins) dans des dispositifs expérimentaux adaptés. Il ou Elle mettra en œuvre des analyses de thermogravimétrie (ATG), de mesure du carbone total et inorganique, ainsi que des techniques de microscopie électronique à balayage (MEB), de Diffraction des Rayons X (DRX) et de  microspectroscopie Raman, afin de caractériser la nature des phases minérales formées, leur morphologie, et les interactions aux interfaces bactéries–biopolymères–substrats. Selon les résultats, il/elle pourra également contribuer à des campagnes de caractérisation avancée en collaboration avec les partenaires du projet.

De manière transversale, le/la post-doctorant·e participera à l’analyse et à la valorisation des résultats, à la rédaction de publications scientifiques internationales et à la diffusion des résultats lors de conférences. Une implication dans le pilotage opérationnel du projet ANR OPTIMIC à La Rochelle Université sera fortement appréciée, notamment pour la coordination des activités scientifiques locales et le suivi des livrables. Le poste s’inscrivant dans une forte dynamique collaborative, le/la post-doctorant·e assurera des échanges réguliers avec les équipes de modélisation numérique, afin d’alimenter et d’interpréter les simulations multi-échelles du projet.

Description du profil recherché

Le poste s’adresse à un·e candidat·e titulaire d’un doctorat (PhD) en microbiologie, biogéosciences, biogéochimie, chimie ou science des matériaux.

Les qualifications clés comprennent :

Solides compétences en microbiologie et/ou en biominéralisation, ainsi qu’une expérience confirmée en culture bactérienne et en expérimentation en laboratoire. Une connaissance des processus de MICP ou des interactions microorganismes/minéraux sera un atout.

Expérience appréciée en caractérisation des matériaux ou des biomatériaux.

Intérêt pour les biopolymères, les milieux poreux et les applications environnementales ou géotechniques.

Rigueur scientifique, capacité avérée à travailler de manière autonome et à gérer efficacement des projets scientifiques et industriels dans un environnement interdisciplinaire, sont attendues.

Excellentes compétences en communication, avec la capacité d’apporter activement son expertise scientifique et ses idées.

La maîtrise de l’anglais écrit et parlé est indispensable.

Type de recrutement

Catégorie : A

Affectation : Laboratoire Littoral Environnement et Sociétés (LIENSs) UMR 7266

Type : CDD 24 mois à compter du 1^er septembre 2026

Si le candidat ou la candidate a obtenu son doctorat depuis moins de trois ans, un contrat postdoctorant pourra être proposé. Au-delà de 3 ans, il s’agira d’un contrat équivalent, en référence aux ingénieurs de recherche

Durée de travail : temps plein

Rémunération : Entre 2 569€ et 2 800€ brut mensuel selon profil et expérience et en référence à la charte de gestion du personnel contractuel de La Rochelle Université.

Recrutement ouvert à toute personne bénéficiaire d’une RQTH

Avantages

• Participation aux frais de transport en commun domicile-travail à hauteur de 75%
• Forfait mobilité durable pour l’utilisation d’un cycle/covoiturage sur les trajets domicile-travail
• Participation Mutuelle
• Restauration collective sur le campus universitaire
• Des offres sport, loisirs et culture pour tous les agents

Contact pour information sur la procédure de recrutement

Marie de Chalendar, Chargée RH pour la recherche, Institut LUDI – marie.de_chalendar@univ-lr.fr

Contact pour information sur le poste à pourvoir

• Sophie SABLE – Enseignant-Chercheur – LIENSs – sophie.sable@univ-lr.fr
• Marc JEANNIN – Enseignant-Chercheur – LaSIE – marc.jeannin@univ-lr.fr

Comment candidater ?

Votre dossier doit impérativement comprendre :

• lettre de motivation explicitant l’adéquation au projet
• curriculum vitae détaillé et liste de publications
• copie du diplôme le plus élevé
• Résumé de la thèse (1 page max.)
• Lettres de recommandation et/ou coordonnées de deux référent·e·s

Ce dossier est à déposer en seul fichier avant le 12 avril 2026 sur l’application dédiée à cet effet accessible en cliquant ici (Référence du poste : RECH/LIENSs/26-03)

A noter : Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique et nécessite donc, conformément à la réglementation, que l’arrivée du ou de la candidate recrutée soit autorisée par l’autorité compétente du MESR.

AUCUN DOSSIER INCOMPLET OU ENVOYÉ PAR MAIL NE SERA ETUDIÉ

• Date limite de candidature : 12 avril 2026.
• Prise de fonctions : à partir du 1^er septembre 2026.

La Rochelle Université détient le label « HR Excellence in Research » qui reconnait son engagement dans la démarche HRS4R.