Ingénieur / Ingénieure d’Etude – Maintenance de paquets (R packages)

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Publié le 23 octobre 2026

La Rochelle Université recrute un ou une ingénieure d’études pour de la maintenance de package analytique R et appui aux analyses au sein de l’Observatoire Pelagis, UAR 3462 La Rochelle Université/CNRS dans le cadre d’un contrat à duré déterminée de 3 mois.

Descriptif de l’employeur

Avec une signature de recherche unique autour des enjeux littoraux, La Rochelle Université affirme une identité forte et porte des projets ambitieux au sein d’un établissement à taille humaine implanté dans un territoire d’exception.

Unité de recherche

L’Observatoire Pelagis est une Unité d’Appui et de Recherche (UAR 3462 La Rochelle Université – CNRS) qui réalise des programmes d’observation et d’expertise pour la conservation des populations de mammifères et d’oiseaux marins. Il gère par ailleurs les bases de données associées à ces divers programmes de recherche. L’adossement de l’Observatoire au Centre d’Études Biologiques de Chizé (CEBC) facilite la valorisation des données de suivi des populations de mammifères et d’oiseaux marins collectées par ces deux unités.

Contexte de recherche

Une des missions de l’Observatoire Pelagis est l’acquisition de données sur la mégafaune marine. Afin de transformer ces données en connaissances mobilisables pour la gestion, l’Observatoire Pelagis a développé une suite de paquets (packages) disponibles à gitlab.univ-lr.fr.

Trois de ces paquets se focalisent sur l’analyse des données de campagnes aériennes et par bateau : pelaCDS, pelaDSM et pelascope. Ces paquets exigent une maintenance continue afin de rester à jour.

Missions du poste

Mettre à jour les paquets pelaCDS, pelaDSM et pelascope.
Fournir un appui technique aux utilisateurs des paquets pelaCDS, pelaDSM et pelascope.
Participer à la rédaction des rendus reposant sur l’utilisation des paquets pelaCDS, pelaDSM et pelascope.
Écrire les méta-données correspondant aux paquets (g. doi, licence, archivage sur https://www. softwareheritage.org/?lang=fr , etc.)

Profil recherché

Profil recherché : Niveau BAC+5 avec expérience précédente.

Savoir-faire indispensables

Maîtrise de R (incluant tidyverse et ggplot2)
Maîtrise de git pour travail collaboratif et maintenance des packages sur le gitlab de LRUniv
Expérience en analyses de données issues de campagnes d’échantillonnage ou de suivis de populations
Connaissances en L^ATEX et/ou markdown/quarto Expérience en rédaction de méta-données

Savoir-faire souhaitables

Connaissances de la mégafaune marine seront un plus mais non indispensables
Connaissances en Distance sampling (Buckland et al. 2015)
Connaissances en écologie marine
Anglais écrit et oral

Savoir-être

Qualités relationnelles et travail en équipe
Autonomie
Capacité à se former à l’utilisation de nouvelles méthodes
Organisation, méthode, rigueur

Type de recrutement

Catégorie : A

Durée de contrat : CDD à temps plein de 3 mois. Prise de poste en février/mars 2027.

Rémunération : 2 300 à 2 500 euros brut mensuel, selon expérience ; Prise en charge des frais de transport en commun à hauteur de 75% ; participation mutuelle.

Recrutement ouvert à toute personne bénéficiaire d’une RQTH

Candidature

CV (2 pages format A4 maximum) et lettre de motivation à déposer en un seul fichier sur l’application dédiée à cet effet accessible en cliquant ici (Référence du poste : RECH/Pelagis/26-22).